外方院长余艾冰院士和中方院长郭烈锦院士：负责研究院全面工作，主要负责研究院的战略规划、国家重大重点项目、重大成果、方向凝练、人才和团队建设等方面工作的指导和把关。

执行院长邱廷省：主持研究院行政全面工作

副院长陈斌：协助邱廷省同志负责学科、科技、人才队伍、平台建设等工作。

副院长赵宝军：分管研究院赣州区域工作，协调赣州与南昌跨区域之间的融合工作。

副院长周宗彦：分管科技、学科建设、平台建设、国际交流与合作等工作。

副院长熊仕显：分管研究院的研究生培养管理工作包括招生就业、培养管理等、教育教学管理、财务管理、实验室建设管理等工作。

副院长许祖华：分管研究院的行政工作包括综合办公室、人事人才、党群、工会、研究生教育、国内交流与合作等有关工作。